Data Output

Data on proposed ORC-binding sites (ACS)

Nieduszynski et al. (2006)
Proposed ACS (proACS) elements based on phylogenetic sequence conservation
chr	start	end	sequence	strand
1	31002	31017	.ATTTTTAAGTTTTGT	+
1	70418	70433	.TTTTTTATGTTTAGA	-
1	124507	124522	.ATATTTAAGTCTTGA	-
1	159951	159966	.TTATTTATATTTAGT	+
1	176232	176247	.CTTTTTATGTTTTCT	+
2	28985	29000	.TTTTTTATAATTTGG	+
2	63355	63370	.TTTTTTAATTTTTGT	-
2	170207	170222	.AGTTTTATATTTAGT	-
2	198370	198385	.AATTTAATGATTAGG	-
2	237819	237834	.CTTTTTACTTTTAGT	-
2	326153	326168	.TTTTTTACATTTTTT	+
2	407988	408003	.TTATTTATATTTTGT	-
2	417957	417972	.TTTTTCATACTATGT	-
2	486843	486858	.ATATTCATGTTTAGT	-
2	622713	622728	.TTATTTATATTTTTC	+
2	704298	704313	.ATATATATATTTAGG	+
2	741726	741741	.TTTTTAACGTTTTGT	-
2	757442	757457	.TTTTTAACGATTTGT	+
2	792173	792188	.GAAATTATGTTTTGT	+
3	166652	166667	.TTATTTATGTTATGT	+
3	194303	194318	.TTTTTTACTTTTAGT	+
3	197536	197551	.ATATTCATGTTTAGT	-
3	224854	224869	.TTTTTTATGTTTTTC	+
3	273009	273024	.TTTTTCAAATTTAGT	-
3	292591	292606	.TTGTTTACTTTTTCT	+
3	315812	315826	.ATTTTTATGTTTAGG	+
4	15666	15681	.TTTTTTACGTTTTCT	-
4	86109	86124	.ATTTTTATGTTTGGG	-
4	123676	123691	.TTGTTTTCACTTTGT	+
4	212578	212593	.TTTTTTATATTTTGT	-
4	253840	253855	.TTTTTATAGTTTTGC	+
4	329726	329741	.ATTTTTATTTTTTTG	-
4	408131	408146	.TATATTATATTTAGC	+
4	484019	484034	.TTTTTTATATTTATG	-
4	505502	505517	.TTTTTTATATTTTTG	-
4	555381	555396	.AAGTTTATGTTTTTT	-
4	567661	567676	.TTTTTTATGTTTTGA	-
4	640047	640062	.TTTTTAAAGTTTTGG	-
4	702924	702939	.TAATTAATGTTTTGG	+
4	748456	748471	.TAATTAATATTTTGT	+
4	753317	753332	.TTTTTTACATTTTGC	-
4	806100	806115	.TTTTTAATATTTAGC	+
4	913856	913871	.ATTTTTATATTTTGT	+
4	921736	921751	.ATTTTAATGATTAGT	+
4	1016830	1016845	.TTGTTTACGTTTTGG	-
4	1057887	1057902	.TTTTTTATGTTTATT	+
4	1110117	1110132	.TTTTTTATATTTTTA	-
4	1240919	1240934	.TGATTTATATTTAGT	+
4	1276267	1276282	.TTTTTCTCATTTTTT	+
4	1302740	1302755	.AAATATATATTTAGT	-
4	1404322	1404337	.CTTTTTATATTTTGG	+
4	1461899	1461914	.TTGTTCATAATTTGT	+
4	1487076	1487091	.CTTTTTAAATTTAGT	-
5	59454	59469	.ATATTTACATTTTGA	-
5	94056	94071	.AAGTTTATATTTTGT	+
5	145698	145713	.AGTTTTTTGTTTAGT	-
5	173792	173807	.AATTTTATATTTTGC	-
5	212455	212470	.AAAATTATGTTTAGG	+
5	287565	287580	.TTATTTATGTTTTGT	+
5	353582	353597	.ATATTTACTTTTTGG	+
5	406887	406902	.TTTTTTATATATAGT	-
5	439086	439101	.TTTTTTAAGTTTTGC	-
5	549585	549600	.TTATTAATATCTTGT	+
7	352849	352864	.TTAATTACGTTTAGT	-
7	508894	508909	.ATTTTAATGTTTGGT	-
7	574702	574717	.GTATTTATGTTTTGT	+
7	999470	999485	.TTTTTTATATTTTTC	+
8	7739	7754	.ATTTTTATATTTAGG	-
8	64300	64315	.AATTTTAATTTTAGT	+
8	133515	133530	.ATTTTAACATTTAGT	-
8	168596	168611	.ATTTAGACATTTAGT	+
8	245789	245804	.TATTTTATGATTAGT	+
8	392238	392253	.CTTTTCATGTTTTGT	-
8	447777	447792	.ATGTTTATGTTTTGT	-
8	501930	501945	.GTTTATACATTTTGT	-
8	556137	556152	.ATTTTTACGTTTAGG	+
9	105951	105966	.TTATTCATGTTTTCT	-
9	136272	136287	.CAGTTTATGTTTTGT	-
9	175170	175185	.TGTTTTATGTTTTGT	+
9	214732	214747	.TAATTTATGTTTTGT	+
9	245864	245879	.TTTTTAATGTTTTGT	-
9	247736	247751	.TTTTTAATGTTTTGT	-
9	342013	342028	.TTTTTAATGTTTAGC	-
9	357222	357237	.ATTTTTATATTTTGT	+
9	411985	412000	.ATTTTAATGTTTTGT	-
10	7716	7731	.ATTTTTATGTTTAGG	-
10	67698	67713	.TTTTTTATTTTTTTT	-
10	99505	99520	.TTTTTAATTTTTTTT	+
10	298616	298631	.TTATTTACCTCTTTT	+
10	337048	337063	.TTTTTTATGTTTAGC	+
10	374639	374654	.TTATTTATAGTTTCT	+
10	375565	375580	.TTTTTTTTGCTTTTT	-
10	417074	417089	.TTTTTTATATTTAGT	-
10	540302	540317	.ATTTTTACATTTAGT	+
10	612757	612772	.TTTTTTATCTTTAGT	-
10	654229	654244	.TTATTTACATTTTGG	-
10	711661	711676	.TTTTTAATGTTTTCT	+
10	729813	729828	.TTTTTTACGTTTTCT	+
10	736890	736905	.ATTTTTATTTTTCGG	-
10	744632	744647	.ATTTTTATGTTTAGG	+
11	55850	55865	.TCATTAATGTTTAGT	-
11	98386	98401	.TTTTTTATGTTTAGT	+
11	153106	153121	.ATTTTTACAATTTGT	-
11	196198	196213	.TTTTTCATTTTTTGT	-
11	213293	213308	.TTTTAAATATTTAGT	-
11	329484	329499	.TTTTTTATGTTTTTT	-
11	388662	388677	.TTGTTTATGTTTATT	+
11	416878	416893	.AAGTTTAATTTTAGG	+
11	447822	447837	.CTTTTTATGTTTTGT	-
11	516680	516695	.TTTTTTACTTTTTGT	+
11	581532	581547	.TTTTTTACATTTAGT	+
11	612030	612045	.TTTTTTATGTTTTTG	-
11	642412	642427	.GATTTTATATTTAGT	+
12	91466	91481	.ATTTTAACGTTTAGT	+
12	156700	156715	.GATTTTACTTTTTGG	+
12	231250	231265	.TTGTTTATATTTTTG	+
12	289406	289421	.AAATTAATGTTTTGC	-
12	373313	373328	.TTTTTTATATTTTCT	-
12	412839	412854	.TGTTTTTTGTTTTGT	-
12	450645	450660	.TTTTTTATATCTTGC	-
12	513070	513085	.TTATTTATGTTTTTG	-
12	603095	603110	.TTTTTAATGTTTATG	-
12	659892	659907	.CTTTTTATGTTTATT	+
12	745100	745115	.ATCTTTATGTTTTGT	-
12	794192	794207	.AAGTTTAAGTTTAGT	-
12	888726	888741	.TTTTTTATGTTTAGA	-
12	1007235	1007250	.ATTTTTATATTTTGT	+
12	1013785	1013800	.TTTTTTATGTTTTCT	+
12	1024136	1024151	.TTAATGATGTTTAGT	-
13	31767	31782	.TAGTTTATTATTAGT	+
13	94375	94390	.TTAATTATATTTAGA	-
13	137321	137336	.ATATTTATGTTTTGT	+
13	184002	184017	.TTATATATGGTTAGT	-
13	263126	263141	.TTTTTTATATTTTGT	+
13	286845	286860	.TTTTTCTTATTTAGT	+
13	371020	371035	.ATTTTATTGTTTAGT	+
13	468236	468251	.TTTTTTATTTTTTGT	+
13	535754	535769	.TAATTTATATTTAGT	-
13	611318	611333	.TTGTTTATGTTTATG	+
13	634522	634537	.ATTTTTACTATTTGT	+
13	649361	649376	.TATTTCATATTTTGT	+
13	758402	758417	.AATTTTATGTTTTTT	-
13	772677	772692	.TTTTTTACTATTACT	+
13	805162	805177	.ATTTTTGTATTTAGT	+
13	815391	815406	.AATTCTATGTTTTGT	+
13	897962	897977	.TTTTTTATGTTTGGT	-
14	28638	28653	.TTTTTTATTTTTAGG	-
14	61694	61709	.TTTTTAATGTTTTGT	+
14	89739	89754	.ATTTTTAAGTTTTGT	-
14	169732	169747	.AATTTAACGTTTTGT	-
14	196209	196224	.TTTTTAACTTTTAGC	-
14	250449	250464	.ATTTTTACGGTTTTT	-
14	280047	280062	.TTATTTATGTTTTTC	-
14	322000	322015	.TTGTTTACGTTTAGG	+
14	412423	412438	.TTTTTTATATTTCTG	-
14	449518	449533	.ATATTTACATTTAGC	-
14	499038	499053	.TTCTTTATGTTTAGC	+
14	546130	546145	.ATTTTTACGTTTTGG	-
14	561311	561326	.TTGTTCACATTTAGT	-
14	609532	609547	.TTTTTTATGTTTATT	+
14	635815	635830	.TTTTTTAATTTTAGT	-
14	691662	691677	.TAATTAACATTTTGT	-
15	35713	35728	.ATATTTATATTTAGA	+
15	72688	72703	.TTTTTTACTTTTAGT	+
15	85350	85365	.ATATTTATGTTTATG	-
15	113894	113909	.TTGTTTATATTTTTG	+
15	167002	167017	.TTATTTATGTTTTCG	+
15	277717	277732	.TTGTTTATCTTTTGT	-
15	337468	337483	.CTTTTTACCTTTTGT	-
15	436792	436807	.ATATTTATTTTTATT	+
15	490046	490061	.TTGTTTTTCTTTTCT	-
15	566582	566597	.AATTTTACCTTTTGA	-
15	656702	656717	.TATTTAATGATTAGT	+
15	729795	729810	.ATTTTTATATTTTGG	+
15	766690	766705	.TATTTTACGTTTTTT	+
15	783387	783402	.ATTTTTAACTTTTGG	+
15	908307	908322	.TTGTTTATGTTTAGG	+
15	981505	981520	.TTATTTATATTTTTC	+
16	43135	43150	.TTGTTTATATTTTTG	-
16	73105	73120	.TTTTTTTTGTTTTTT	+
16	116593	116608	.ATTTTTATGTTTTGT	+
16	289531	289546	.TAATTAATGTTTACT	+
16	384592	384607	.AAATTTATGTTTATG	+
16	418178	418193	.TTATTTACAATTAGT	+
16	456744	456759	.TTTATTATTTTTTGT	-
16	511704	511719	.ATTTTTATGTTTTTT	+
16	563877	563892	.TCTTTTATATTTAGT	+
16	565115	565130	.TTTTTAATTTTTAGT	+
16	633921	633936	.TTTTTATAGTTTAGT	+
16	684405	684420	.TTTTTTACTTTTTGT	+
16	695603	695618	.TTTTTTTAATTTTCT	-
16	749117	749132	.ATTTTTAAGTTTAGT	+
16	819324	819339	.ATTTTTATATTTATT	-
16	842836	842851	.TTATTTAGATTTAGT	-
16	880906	880921	.TATTTTATGTTTAGG	+
16	933149	933164	.TTATTTACGTTTAGC	-